複数のPCで使わせていただいています。
同じ設定をしているのですが、通知のポップアップが表示できるPCとできないPCがあります。チェックする項目はどこでしょうか？

フォルダ監視のご利用ありがとうございます。

> 同じ設定をしているのですが、通知のポップアップが表示できるPCとできないPCがあります。チェックする項目はどこでしょうか？

「タスクトレイで通知後、クリックで一覧表示する」のチェックがONになっているとタスクトレイで点滅、または点灯後、アイコンクリックで一覧画面が表示されるようになります。
参考：タスクトレイで通知後、クリックで一覧表示する - フォルダ監視オンラインマニュアル
https://bit.ly/2IUNkHx

また「変更ファイル検知時にプログラムを起動する」のチェックがONになっているとプログラムを起動する設定になってしまい、一覧画面は表示されなくなります。
参考：変更ファイル検知時にプログラムを起動する - フォルダ監視オンラインマニュアル
https://bit.ly/3yj4XJa

複数のパソコンで監視するフォルダまでのフルパスが全く同一であれば、設定ファイル等一式をコピーすることで同一の設定にすることも可能です。
※それぞれのパソコンから参照した場合の、監視フォルダのドライブ名やフォルダ名が異なる場合はコピーすることはできませんのでご注意ください。
参考：複数のＰＣにインストールするには - フォルダ監視オンラインマニュアル
https://bit.ly/37iJRil