便利なので使わせてもらってます。

フォルダの中の変化を検知した後、タスクトレイにあるアイコンをクリックするまで監視を中断しているようですが
監視を中断しないように設定する事はできますか？

フォルダ監視のご利用ありがとうございます。

> フォルダの中の変化を検知した後、タスクトレイにあるアイコンをクリックするまで監視を中断しているようですが監視を中断しないように設定する事はできますか？

変更ファイル一覧が表示されている状態でも監視を中断させたくないということでしょうか？
現バージョンの仕様では、変更ファイル一覧が表示されている間は一時中断しており、表示中でも監視を指示することはできません。

変更ファイル一覧を閉じた時点で経過時間を加味して監視間隔に設定してある時間を経過した時点で再びチェックされるようになっています。

現時点では一覧表示されている状態で監視を継続して変更を一覧に反映させるような機能追加の予定はありません。

なお、変更ファイル一覧を取りあえず閉じて次回に再び表示させたい場合は、ESCキーで一覧画面を閉じて下さい。